Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Ccl28Q9JIL2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Ccl28Q9JIL2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Ccl28Q9JIL2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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