Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG8

Praf2, PRA1 family protein 2, mousemouse

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Length 178 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Praf2Q9JIG8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Praf2Q9JIG8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Praf2Q9JIG8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Praf2Q9JIG8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Praf2Q9JIG8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Praf2Q9JIG8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Praf2Q9JIG8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Praf2Q9JIG8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Praf2Q9JIG8 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Praf2Q9JIG8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Praf2Q9JIG8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Praf2Q9JIG8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Praf2Q9JIG8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Praf2Q9JIG8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Praf2Q9JIG8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Praf2Q9JIG8 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Praf2Q9JIG8 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Praf2Q9JIG8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Praf2Q9JIG8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Praf2Q9JIG8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Praf2Q9JIG8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Praf2Q9JIG8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Praf2Q9JIG8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Praf2Q9JIG8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Praf2Q9JIG8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Praf2Q9JIG8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Praf2Q9JIG8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Praf2Q9JIG8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Praf2Q9JIG8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Praf2Q9JIG8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Praf2Q9JIG8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Praf2Q9JIG8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Praf2Q9JIG8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Praf2Q9JIG8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Praf2Q9JIG8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Praf2Q9JIG8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Praf2Q9JIG8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Praf2Q9JIG8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Praf2Q9JIG8 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Praf2Q9JIG8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Praf2Q9JIG8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Praf2Q9JIG8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Praf2Q9JIG8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Praf2Q9JIG8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Praf2Q9JIG8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Praf2Q9JIG8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Praf2Q9JIG8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Praf2Q9JIG8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Praf2Q9JIG8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Praf2Q9JIG8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Praf2Q9JIG8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Praf2Q9JIG8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Praf2Q9JIG8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Praf2Q9JIG8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Praf2Q9JIG8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Praf2Q9JIG8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Praf2Q9JIG8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Praf2Q9JIG8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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