Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc22Q9JIG7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms