Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gtf2ird1Q9JI57 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms