Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms