Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cldn19Q9ET38 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms