Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG2

Ropn1, Ropporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1Q9ESG2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ropn1Q9ESG2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms