Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms