Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK7

Chrnb2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb2Q9ERK7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Chrnb2Q9ERK7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Chrnb2Q9ERK7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Chrnb2Q9ERK7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Chrnb2Q9ERK7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Chrnb2Q9ERK7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Chrnb2Q9ERK7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Chrnb2Q9ERK7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrnb2Q9ERK7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrnb2Q9ERK7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrnb2Q9ERK7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrnb2Q9ERK7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrnb2Q9ERK7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrnb2Q9ERK7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrnb2Q9ERK7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrnb2Q9ERK7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrnb2Q9ERK7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrnb2Q9ERK7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrnb2Q9ERK7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrnb2Q9ERK7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrnb2Q9ERK7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrnb2Q9ERK7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrnb2Q9ERK7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrnb2Q9ERK7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrnb2Q9ERK7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrnb2Q9ERK7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrnb2Q9ERK7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms