Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERG0

Lima1, LIM domain and actin-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lima1Q9ERG0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lima1Q9ERG0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms