Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms