Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tfcp2Q9ERA0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tfcp2Q9ERA0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tfcp2Q9ERA0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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