Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms