Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER42

Barx1, Homeobox protein BarH-like 1, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx1Q9ER42 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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