Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQU3

Tlr9, Toll-like receptor 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr9Q9EQU3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tlr9Q9EQU3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tlr9Q9EQU3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tlr9Q9EQU3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tlr9Q9EQU3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tlr9Q9EQU3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tlr9Q9EQU3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tlr9Q9EQU3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tlr9Q9EQU3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tlr9Q9EQU3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tlr9Q9EQU3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr9Q9EQU3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms