Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms