Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU4

Cpsf1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf1Q9EPU4 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cpsf1Q9EPU4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cpsf1Q9EPU4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cpsf1Q9EPU4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cpsf1Q9EPU4 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cpsf1Q9EPU4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cpsf1Q9EPU4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cpsf1Q9EPU4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cpsf1Q9EPU4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpsf1Q9EPU4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpsf1Q9EPU4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpsf1Q9EPU4 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpsf1Q9EPU4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpsf1Q9EPU4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpsf1Q9EPU4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpsf1Q9EPU4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpsf1Q9EPU4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpsf1Q9EPU4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpsf1Q9EPU4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpsf1Q9EPU4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpsf1Q9EPU4 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpsf1Q9EPU4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpsf1Q9EPU4 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpsf1Q9EPU4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpsf1Q9EPU4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpsf1Q9EPU4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpsf1Q9EPU4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpsf1Q9EPU4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpsf1Q9EPU4 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpsf1Q9EPU4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cpsf1Q9EPU4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cpsf1Q9EPU4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cpsf1Q9EPU4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cpsf1Q9EPU4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cpsf1Q9EPU4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cpsf1Q9EPU4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cpsf1Q9EPU4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cpsf1Q9EPU4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cpsf1Q9EPU4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cpsf1Q9EPU4 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cpsf1Q9EPU4 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cpsf1Q9EPU4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cpsf1Q9EPU4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cpsf1Q9EPU4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cpsf1Q9EPU4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cpsf1Q9EPU4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cpsf1Q9EPU4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms