Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK8

Trpv4, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 4, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv4Q9EPK8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms