Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCP2

Slc38a3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a3Q9DCP2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms