Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCM4

Dnal4, Dynein light chain 4, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnal4Q9DCM4 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dnal4Q9DCM4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dnal4Q9DCM4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dnal4Q9DCM4 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dnal4Q9DCM4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dnal4Q9DCM4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dnal4Q9DCM4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dnal4Q9DCM4 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dnal4Q9DCM4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dnal4Q9DCM4 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dnal4Q9DCM4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dnal4Q9DCM4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dnal4Q9DCM4 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dnal4Q9DCM4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dnal4Q9DCM4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dnal4Q9DCM4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dnal4Q9DCM4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dnal4Q9DCM4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Dnal4Q9DCM4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Dnal4Q9DCM4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dnal4Q9DCM4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dnal4Q9DCM4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Dnal4Q9DCM4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dnal4Q9DCM4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dnal4Q9DCM4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dnal4Q9DCM4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dnal4Q9DCM4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dnal4Q9DCM4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dnal4Q9DCM4 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dnal4Q9DCM4 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dnal4Q9DCM4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dnal4Q9DCM4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Dnal4Q9DCM4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Dnal4Q9DCM4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Dnal4Q9DCM4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Dnal4Q9DCM4 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dnal4Q9DCM4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dnal4Q9DCM4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dnal4Q9DCM4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dnal4Q9DCM4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dnal4Q9DCM4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dnal4Q9DCM4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dnal4Q9DCM4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dnal4Q9DCM4 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dnal4Q9DCM4 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dnal4Q9DCM4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dnal4Q9DCM4 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dnal4Q9DCM4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dnal4Q9DCM4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dnal4Q9DCM4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dnal4Q9DCM4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dnal4Q9DCM4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dnal4Q9DCM4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dnal4Q9DCM4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dnal4Q9DCM4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Dnal4Q9DCM4 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Dnal4Q9DCM4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dnal4Q9DCM4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dnal4Q9DCM4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dnal4Q9DCM4 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dnal4Q9DCM4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dnal4Q9DCM4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dnal4Q9DCM4 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Dnal4Q9DCM4 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dnal4Q9DCM4 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Dnal4Q9DCM4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Dnal4Q9DCM4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dnal4Q9DCM4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Dnal4Q9DCM4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dnal4Q9DCM4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dnal4Q9DCM4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dnal4Q9DCM4 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dnal4Q9DCM4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dnal4Q9DCM4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dnal4Q9DCM4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dnal4Q9DCM4 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dnal4Q9DCM4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dnal4Q9DCM4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Dnal4Q9DCM4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dnal4Q9DCM4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dnal4Q9DCM4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dnal4Q9DCM4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dnal4Q9DCM4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dnal4Q9DCM4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dnal4Q9DCM4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dnal4Q9DCM4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dnal4Q9DCM4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dnal4Q9DCM4 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dnal4Q9DCM4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dnal4Q9DCM4 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dnal4Q9DCM4 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms