Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC61

Pmpca, Mitochondrial-processing peptidase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcaQ9DC61 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PmpcaQ9DC61 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PmpcaQ9DC61 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PmpcaQ9DC61 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PmpcaQ9DC61 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms