Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccdc97Q9DBT3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc97Q9DBT3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms