Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAT5

Trmu, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmuQ9DAT5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrmuQ9DAT5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms