Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9DA42 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9DA42 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9DA42 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9DA42 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9DA42 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9DA42 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9DA42 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9DA42 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9DA42 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9DA42 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9DA42 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9DA42 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9DA42 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9DA42 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9DA42 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9DA42 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9DA42 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9DA42 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9DA42 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9DA42 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9DA42 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9DA42 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9DA42 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9DA42 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9DA42 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9DA42 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9DA42 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9DA42 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9DA42 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9DA42 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9DA42 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9DA42 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9DA42 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9DA42 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9DA42 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9DA42 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9DA42 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9DA42 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9DA42 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9DA42 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9DA42 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9DA42 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9DA42 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9DA42 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9DA42 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9DA42 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9DA42 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9DA42 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9DA42 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9DA42 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9DA42 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9DA42 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9DA42 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9DA42 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9DA42 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9DA42 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9DA42 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9DA42 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9DA42 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9DA42 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9DA42 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9DA42 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9DA42 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9DA42 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9DA42 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9DA42 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9DA42 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9DA42 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9DA42 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9DA42 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9DA42 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9DA42 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9DA42 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9DA42 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9DA42 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9DA42 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9DA42 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9DA42 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9DA42 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9DA42 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9DA42 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9DA42 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9DA42 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9DA42 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9DA42 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9DA42 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9DA42 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9DA42 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9DA42 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9DA42 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9DA42 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9DA42 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9DA42 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9DA42 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9DA42 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9DA42 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9DA42 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9DA42 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9DA42 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms