Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms