Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms