Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmco5aQ9D9D5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmco5aQ9D9D5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmco5aQ9D9D5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmco5aQ9D9D5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmco5aQ9D9D5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmco5aQ9D9D5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms