Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg7Q9D906 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms