Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U0

Ifrd2, Interferon-related developmental regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd2Q9D8U0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifrd2Q9D8U0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms