Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms