Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
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Q9D8Q6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Q9D8Q6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Q9D8Q6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Q9D8Q6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Q9D8Q6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
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Q9D8Q6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Q9D8Q6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Q9D8Q6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Q9D8Q6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Q9D8Q6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Q9D8Q6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Q9D8Q6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Q9D8Q6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Q9D8Q6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q9D8Q6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms