Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7T1

Rep15, Rab15 effector protein, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rep15Q9D7T1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Rep15Q9D7T1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Rep15Q9D7T1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Rep15Q9D7T1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Rep15Q9D7T1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rep15Q9D7T1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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