Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp5Q9D7S9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chmp5Q9D7S9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chmp5Q9D7S9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chmp5Q9D7S9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chmp5Q9D7S9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Chmp5Q9D7S9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chmp5Q9D7S9 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Chmp5Q9D7S9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chmp5Q9D7S9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chmp5Q9D7S9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chmp5Q9D7S9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms