Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J9

Echdc3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Echdc3Q9D7J9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Echdc3Q9D7J9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.8 ms