Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
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Cldn23Q9D7D7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Cldn23Q9D7D7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Cldn23Q9D7D7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Cldn23Q9D7D7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Cldn23Q9D7D7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Cldn23Q9D7D7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Cldn23Q9D7D7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Cldn23Q9D7D7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Cldn23Q9D7D7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cldn23Q9D7D7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn23Q9D7D7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn23Q9D7D7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn23Q9D7D7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn23Q9D7D7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn23Q9D7D7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn23Q9D7D7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn23Q9D7D7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn23Q9D7D7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn23Q9D7D7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn23Q9D7D7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn23Q9D7D7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn23Q9D7D7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn23Q9D7D7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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