Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nop56Q9D6Z1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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