Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms