Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I0

Rtl8c, Cxx1c protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl8cQ9D6I0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl8cQ9D6I0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl8cQ9D6I0 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl8cQ9D6I0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl8cQ9D6I0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl8cQ9D6I0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rtl8cQ9D6I0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl8cQ9D6I0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl8cQ9D6I0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl8cQ9D6I0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl8cQ9D6I0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl8cQ9D6I0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rtl8cQ9D6I0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl8cQ9D6I0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rtl8cQ9D6I0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl8cQ9D6I0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl8cQ9D6I0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rtl8cQ9D6I0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Rtl8cQ9D6I0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Rtl8cQ9D6I0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Rtl8cQ9D6I0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Rtl8cQ9D6I0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Rtl8cQ9D6I0 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Rtl8cQ9D6I0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Rtl8cQ9D6I0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Rtl8cQ9D6I0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl8cQ9D6I0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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