Protein–RNA interactions for Protein: Q9D662

Sec23b, Protein transport protein Sec23B, mousemouse

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23bQ9D662 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Sec23bQ9D662 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Sec23bQ9D662 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec23bQ9D662 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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