Protein–RNA interactions for Protein: Q9D646

Krt34, Keratin, type I cuticular Ha4, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt34Q9D646 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt34Q9D646 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt34Q9D646 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt34Q9D646 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt34Q9D646 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt34Q9D646 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt34Q9D646 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt34Q9D646 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt34Q9D646 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt34Q9D646 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt34Q9D646 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt34Q9D646 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt34Q9D646 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt34Q9D646 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt34Q9D646 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt34Q9D646 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt34Q9D646 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt34Q9D646 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Krt34Q9D646 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Krt34Q9D646 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Krt34Q9D646 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Krt34Q9D646 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Krt34Q9D646 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Krt34Q9D646 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Krt34Q9D646 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Krt34Q9D646 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Krt34Q9D646 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Krt34Q9D646 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Krt34Q9D646 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Krt34Q9D646 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Krt34Q9D646 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms