Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rab11fip1Q9D620 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms