Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q8

Uncharacterized protein C1orf141 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D5Q8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms