Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4K7

Ccdc105, Coiled-coil domain-containing protein 105, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc105Q9D4K7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc105Q9D4K7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc105Q9D4K7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc105Q9D4K7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc105Q9D4K7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc105Q9D4K7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc105Q9D4K7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc105Q9D4K7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc105Q9D4K7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc105Q9D4K7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc105Q9D4K7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc105Q9D4K7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc105Q9D4K7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc105Q9D4K7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc105Q9D4K7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc105Q9D4K7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc105Q9D4K7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc105Q9D4K7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc105Q9D4K7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc105Q9D4K7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc105Q9D4K7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc105Q9D4K7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc105Q9D4K7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc105Q9D4K7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc105Q9D4K7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc105Q9D4K7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc105Q9D4K7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc105Q9D4K7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc105Q9D4K7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc105Q9D4K7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc105Q9D4K7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc105Q9D4K7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc105Q9D4K7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc105Q9D4K7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc105Q9D4K7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc105Q9D4K7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc105Q9D4K7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc105Q9D4K7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc105Q9D4K7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc105Q9D4K7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc105Q9D4K7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc105Q9D4K7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc105Q9D4K7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc105Q9D4K7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc105Q9D4K7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc105Q9D4K7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc105Q9D4K7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc105Q9D4K7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc105Q9D4K7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc105Q9D4K7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc105Q9D4K7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc105Q9D4K7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc105Q9D4K7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc105Q9D4K7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc105Q9D4K7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc105Q9D4K7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc105Q9D4K7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc105Q9D4K7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc105Q9D4K7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc105Q9D4K7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc105Q9D4K7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc105Q9D4K7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc105Q9D4K7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc105Q9D4K7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc105Q9D4K7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc105Q9D4K7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc105Q9D4K7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc105Q9D4K7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc105Q9D4K7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc105Q9D4K7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms