Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D454 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D454 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D454 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D454 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D454 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D454 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D454 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D454 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D454 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D454 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D454 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D454 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D454 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D454 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D454 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D454 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D454 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D454 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D454 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D454 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D454 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D454 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D454 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D454 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D454 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D454 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D454 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D454 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D454 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D454 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D454 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D454 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D454 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D454 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D454 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D454 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D454 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D454 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D454 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D454 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D454 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D454 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D454 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D454 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D454 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D454 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D454 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D454 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D454 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D454 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D454 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D454 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D454 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D454 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D454 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D454 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D454 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D454 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D454 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D454 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D454 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D454 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D454 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D454 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D454 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D454 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D454 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D454 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D454 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D454 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D454 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D454 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D454 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D454 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D454 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D454 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D454 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D454 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D454 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D454 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D454 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D454 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D454 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D454 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D454 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D454 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D454 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D454 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D454 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D454 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D454 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D454 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D454 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D454 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D454 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D454 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D454 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D454 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D454 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms