Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X4

4933428G20Rik, RIKEN cDNA 4933428G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428G20RikQ9D3X4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms