Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx29Q9D3S3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms