Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rufy3Q9D394 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Rufy3Q9D394 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rufy3Q9D394 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rufy3Q9D394 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rufy3Q9D394 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rufy3Q9D394 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Rufy3Q9D394 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rufy3Q9D394 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rufy3Q9D394 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Rufy3Q9D394 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Rufy3Q9D394 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rufy3Q9D394 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rufy3Q9D394 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rufy3Q9D394 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rufy3Q9D394 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rufy3Q9D394 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rufy3Q9D394 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rufy3Q9D394 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rufy3Q9D394 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rufy3Q9D394 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rufy3Q9D394 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rufy3Q9D394 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms