Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan11Q9D1D1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms