Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mrpl28Q9D1B9 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms