Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem53Q9D0Z3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms